Michael Kaiser studierte Geschichte, Latein und Mittellatein an der Universität zu Köln. 1997 promovierte er ebenda mit einer Studie zum Dreißigjährigen Krieg. Seit 2008 ist er bei der »Max Weber Stiftung – Deutsche Geisteswissenschaftliche Institute im Ausland« für den Aufbau von Forschungsinfrastrukturen zuständig. Lehraufträge führten ihn an die Universitäten Bonn und Köln. Seine Forschungen gelten dem Dreißigjährigen Krieg, der politischen Kultur der Landstände sowie der brandenburgischen Geschichte, insbesondere in der Zeit des Jülich-Klevischen Erbfolgestreits.